Protocol
- プレートを StepOne にセットする。
- Windows にログインする。Username: Administrator、Password: なし。
- デスクトップの「StepOne Software」を起動し、User Name: GUEST でログインする。
- ダイアログが出てくるが、「Ignore & Continue Setup」を押して続行する。
- メニュー画面で「Advanced Setup」を選択する。
- 左上が「Experiment Prpoerties」の画面で、以下の設定を行う。
- 「Experiment Name」にプレートの名前 (日付, サンプル名, 遺伝子名など) を入力。
- 「StepOne Instrument 48 wells」を選択。
- 「Quantification - Comparative CT (ΔΔCT)」を選択。
- 「SYBR Green Reagents」を選択。「Include Melt Curve」のチェックを確認。
- 「Standard (~2 hours to complete a run)」を選択。
- 左上の「Plate Setup」を選択し、以下の設定を行う。
- 上のタブが「Define Targets and Samples」になっている。
- 「Define Targets」の Name に遺伝子名 (プライマー) を入力する。「Add New Target」で欄を増やす。
- 「Define Samples」の Name にサンプル名 (cDNA) を入力する。「Add New Sample」で欄を増やす。
- 上のタブを「Assign Targets and Samples」に切り替える。
- Well を選択し、該当する Targets と Samples をチェックする。
- 入力が終了したら、全ての well を選択し、左下の「Select the dye to use as the passive reference」(最初は「ROX」になっている) を「None」にする。
- 左上の「Run Method」を選択し、「Reaction Volume Per Well」が「20 ul」、PCR の「Number of Cycles」が「40」であることを確認する。
- 左上の「Run」を選択し、「START RUN」ボタンを押す。
- 「Calibration Expired」のダイアログが出てくるが、「Yes」を押して続行する。
- ファイルを保存する。ファイル名を入力し、デスクトップの個人フォルダに保存する。
- しばらくすると Run が始まる (StepOne が動作する)。画面に残り時間 (約 120 min) が表示されることを確認する。
References
Nihashi Y, Ono T, Kagami H, Takaya T*. Toll-like receptor ligand-dependent inflammatory responses in chick skeletal muscle myoblasts. Dev Comp Immunol. 2019; 91: 115-122.
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Shinji S, Nakamura S, Nihashi Y, Umezawa K, Takaya T*. Berberine and palmatine inhibit the growth of human rhabdomyosarcoma cells. Biosci Biotechnol Biochem. 2020; 84: 63-75.
Takaya T*, Nihashi Y, Kojima S, Ono T, Kagami H. Autonomous xenogenic cell fusion of murine and chick skeletal muscle myoblasts. Anim Sci J. 2017; 88: 1880-1885.